Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms