Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms