Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PHF3Q92576 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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