Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms