Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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