Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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