Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms