Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
NTF3P20783 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NTF3P20783 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms