Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LY9Q9HBG7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms