Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRIMPOLQ96LW4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms