Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms