Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC13P31276 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms