Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSTPIP1O43586 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms