Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms