Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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