Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms