Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDCP19113 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HDCP19113 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms