Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MSI1O43347 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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