Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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