Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EDRF1Q3B7T1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms