Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TRIP13Q15645 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TRIP13Q15645 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TRIP13Q15645 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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