Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms