Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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