Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC3H12CQ9C0D7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms