Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PRPF18Q99633 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRPF18Q99633 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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