Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM71DQ8N9W8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71DQ8N9W8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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