Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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