Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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