Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms