Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFI35P80217 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFI35P80217 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFI35P80217 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms