Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP7P55210 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP7P55210 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP7P55210 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP7P55210 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP7P55210 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP7P55210 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms