Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DESP17661 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DESP17661 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DESP17661 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DESP17661 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DESP17661 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DESP17661 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DESP17661 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DESP17661 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms