Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MSCO60682 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MSCO60682 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MSCO60682 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms