Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L4A6NEF3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms