Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms