Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3LQ9UJW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3LQ9UJW3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms