Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SS18L2Q9UHA2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SS18L2Q9UHA2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SS18L2Q9UHA2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SS18L2Q9UHA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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