Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms