Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIPAS39Q9H9C1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms