Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HIRIP3Q9BW71 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HIRIP3Q9BW71 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms