Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPAS2Q99743 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms