Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP61Q8NHU2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms