Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FSIP1Q8NA03 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSIP1Q8NA03 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms