Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN9Q5TKA1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIN9Q5TKA1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms