Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms