Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 GRK6-205ENST00000506296 955 ntTSL 518.92■□□□□ 0.624e-7■■■□□ 16.2
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PUM1Q14671 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 218.55■□□□□ 0.564e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 BRI3-202ENST00000456357 667 ntTSL 218.44■□□□□ 0.544e-10■■■□□ 16.2
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PUM1Q14671 KRT8-202ENST00000546542 765 ntTSL 318.23■□□□□ 0.514e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.54e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.54e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.494e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 RPS6KB2-207ENST00000525996 957 ntTSL 518.02■□□□□ 0.484e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-29■■■□□ 16.2
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PUM1Q14671 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 517.8■□□□□ 0.444e-7■■■□□ 16.2
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PUM1Q14671 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 516.5■□□□□ 0.234e-7■■■□□ 16.2
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PUM1Q14671 SMURF1-203ENST00000472627 825 ntTSL 215.94■□□□□ 0.144e-7■■■□□ 16.2
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PUM1Q14671 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLC2A3-207ENST00000495813 1784 ntTSL 28.78□□□□□ -14e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 NSMCE2-209ENST00000521460 645 ntTSL 58.69□□□□□ -1.024e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 PPME1-205ENST00000539021 4055 ntTSL 28.29□□□□□ -1.084e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)8.02□□□□□ -1.134e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.164e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.184e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 27.38□□□□□ -1.234e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 PPME1-206ENST00000541340 3618 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.254e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 OTUD6B-204ENST00000524027 1330 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.274e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 PPME1-204ENST00000538501 744 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.324e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLC2A3-203ENST00000476634 763 ntTSL 26.73□□□□□ -1.334e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLC2A3-210ENST00000544291 577 ntTSL 56.33□□□□□ -1.44e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.474e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.494e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLC2A3-211ENST00000544936 589 ntTSL 45.35□□□□□ -1.554e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.182e-8■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-8■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 221.93■■□□□ 1.16e-8■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 16.1
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