Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDM2Q00987 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM2Q00987 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms