Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RND2P52198 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RND2P52198 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RND2P52198 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RND2P52198 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RND2P52198 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RND2P52198 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND2P52198 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND2P52198 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND2P52198 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RND2P52198 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RND2P52198 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RND2P52198 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RND2P52198 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND2P52198 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND2P52198 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND2P52198 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND2P52198 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RND2P52198 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND2P52198 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND2P52198 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND2P52198 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND2P52198 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RND2P52198 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms