Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNJ1P48048 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNJ1P48048 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms