Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL13AP40429 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms